More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1191 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 744 aa  1509    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  46.45 
 
 		 731 aa  582  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  46.45 
 
 		 731 aa  582  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  45.42 
 
 		 708 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  44.81 
 
 		 716 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  44.18 
 
 		 718 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  43.74 
 
 		 697 aa  535  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 728 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  39.95 
 
 		 727 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 675 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 683 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 654 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 674 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.86 
 
 		 675 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 657 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  33.75 
 
 		 682 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 668 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 667 aa  347  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 663 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 693 aa  313  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 656 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 690 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.9 
 
 		 653 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 665 aa  150  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 678 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 669 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 709 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 682 aa  103  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 836 aa  95.5  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 715 aa  95.5  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 649 aa  95.9  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.99 
 
 		 663 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 815 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 627 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 642 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.7 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.19 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 702 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 828 aa  79.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 845 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 632 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  21.08 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.96 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.16 
 
 		 676 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.96 
 
 		 666 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.96 
 
 		 666 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  20.11 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 670 aa  75.1  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  24.5 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 668 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.35 
 
 		 666 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  22.66 
 
 		 807 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.05 
 
 		 638 aa  72.4  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 793 aa  72  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  20.81 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  26.42 
 
 		 779 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 664 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 762 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  23.34 
 
 		 689 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.85 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 730 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.49 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 655 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.35 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.35 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 764 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 742 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 758 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 746 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.35 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  22.99 
 
 		 757 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  27.3 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 769 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.21 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 571 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 695 aa  65.1  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>