More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3697 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 731 aa  1478    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  48.49 
 
 		 716 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  99.59 
 
 		 731 aa  1473    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  52.28 
 
 		 697 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  45.91 
 
 		 708 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  46.32 
 
 		 718 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  46.45 
 
 		 744 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  41.93 
 
 		 728 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  40.83 
 
 		 727 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 654 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 674 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 675 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 683 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.38 
 
 		 675 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 685 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 657 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 667 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 668 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  33.29 
 
 		 682 aa  348  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 693 aa  331  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 663 aa  307  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 690 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.03 
 
 		 653 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 		 678 aa  147  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 665 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 669 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 651 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 670 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 655 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 613 aa  97.8  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 699 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 709 aa  94  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 659 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.35 
 
 		 646 aa  91.3  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 642 aa  90.9  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  21.55 
 
 		 634 aa  90.5  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 836 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 682 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  29.8 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 845 aa  77.8  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 662 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 764 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 673 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 664 aa  75.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.08 
 
 		 807 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.24 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 655 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 634 aa  73.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 656 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 773 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 698 aa  70.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  22.36 
 
 		 689 aa  70.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  25.79 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  23.42 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  23.42 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 714 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  23.42 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  28.45 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 688 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  23.42 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  23.42 
 
 		 760 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 760 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  23.1 
 
 		 760 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  23.1 
 
 		 760 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  21.95 
 
 		 676 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 742 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  21.64 
 
 		 680 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 760 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  22.32 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  23.04 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  28.44 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 736 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 627 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 766 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 840 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>