More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1453 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  53.14 
 
 		 782 aa  865    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 791 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  37.53 
 
 		 799 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  39.49 
 
 		 797 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  36.95 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1117 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 792 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 713 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  29.39 
 
 		 767 aa  336  7.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 823 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 788 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 763 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 		 781 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  28.68 
 
 		 960 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  32.93 
 
 		 848 aa  116  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 795 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 760 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 776 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  31.58 
 
 		 833 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 778 aa  101  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 836 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 757 aa  99  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 866 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 753 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 943 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 845 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 828 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 833 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1004 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 933 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 918 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 785 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 793 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 828 aa  80.9  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1066 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 814 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 938 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 769 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 767 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 882 aa  78.2  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1147 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 919 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 763 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 888 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1097 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 809 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 651 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 753 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1075 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 789 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 962 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1089 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 815 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 779 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 806 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1047 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 815 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 920 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 989 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1019 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1082 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 698 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  24.54 
 
 		 808 aa  72  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 962 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 931 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1090 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 791 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 812 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1036 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  29.1 
 
 		 620 aa  69.7  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1075 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 887 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1062 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 999 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 791 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1202 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 668 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 1102 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>