More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1237 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  56.2 
 
 		 742 aa  804    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  55.03 
 
 		 737 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 736 aa  1508    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  41.33 
 
 		 762 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 742 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 719 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 764 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 761 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 772 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 772 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 778 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 778 aa  187  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 778 aa  187  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 778 aa  187  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 778 aa  187  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 778 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 784 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 788 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  26.62 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 786 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 784 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 788 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 874 aa  167  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  24.83 
 
 		 779 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 794 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 804 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 760 aa  152  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 702 aa  147  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.64 
 
 		 650 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.64 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.5 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.5 
 
 		 650 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.36 
 
 		 650 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 821 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 649 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 649 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 782 aa  134  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 635 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.13 
 
 		 807 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 665 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 670 aa  128  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 653 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 740 aa  126  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 662 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 662 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  24.56 
 
 		 780 aa  124  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 680 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 732 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 661 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 662 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.57 
 
 		 744 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 699 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 836 aa  114  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.81 
 
 		 744 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.28 
 
 		 744 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 602 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 698 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 679 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 713 aa  111  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.52 
 
 		 653 aa  107  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  41.88 
 
 		 656 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  41.29 
 
 		 634 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 714 aa  104  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  34.98 
 
 		 646 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 		 634 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 815 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  37.27 
 
 		 623 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 686 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  39.13 
 
 		 663 aa  100  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  39.13 
 
 		 659 aa  100  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  39.13 
 
 		 663 aa  100  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 707 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  39.13 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  34.48 
 
 		 661 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  39.13 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  39.13 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  22.41 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.42 
 
 		 619 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  43.97 
 
 		 732 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 795 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 665 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 682 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 693 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.16 
 
 		 746 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 701 aa  97.4  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  34.32 
 
 		 611 aa  97.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  34.62 
 
 		 655 aa  97.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 611 aa  96.3  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  39.86 
 
 		 639 aa  95.5  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  41.67 
 
 		 641 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  35.54 
 
 		 633 aa  94.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>