More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4645 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 693 aa  1430    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  41.25 
 
 		 668 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  38.46 
 
 		 675 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 675 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 657 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 685 aa  416  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 683 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 674 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  32.25 
 
 		 682 aa  362  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  36.4 
 
 		 654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 697 aa  346  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 731 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 708 aa  330  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 731 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 716 aa  317  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 744 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 656 aa  296  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 663 aa  290  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 718 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 656 aa  273  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 728 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.34 
 
 		 653 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 690 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 665 aa  128  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 663 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 678 aa  124  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 615 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 635 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 651 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  21.05 
 
 		 677 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.85 
 
 		 646 aa  99.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 602 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 736 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  20.97 
 
 		 650 aa  97.1  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 692 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 669 aa  93.2  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  22.43 
 
 		 671 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  19.71 
 
 		 649 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 634 aa  91.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 581 aa  91.3  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 682 aa  90.9  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 637 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  23.42 
 
 		 662 aa  88.6  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 699 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1019  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 572 aa  87.8  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.463707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.18 
 
 		 659 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 741 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 698 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  20.64 
 
 		 695 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.33 
 
 		 663 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.33 
 
 		 663 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.53 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.33 
 
 		 663 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.33 
 
 		 663 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  21.31 
 
 		 666 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.33 
 
 		 663 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.33 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 709 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.34 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  22.97 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.18 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  22.49 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.18 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  22.21 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.18 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.44 
 
 		 616 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 670 aa  80.9  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  21.21 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 695 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 627 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 612 aa  79.7  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.95 
 
 		 739 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  20.89 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  32 
 
 		 677 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.07 
 
 		 661 aa  77.8  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  22.46 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 749 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  22.91 
 
 		 656 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 767 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  23.25 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 737 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  21.53 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  21.15 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 715 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  20.89 
 
 		 665 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>