More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3699 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  56.41 
 
 
675 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  100 
 
 
685 aa  1412    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  51.71 
 
 
683 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  47.52 
 
 
674 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  43.83 
 
 
657 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  43.52 
 
 
675 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  42.41 
 
 
668 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  42.43 
 
 
654 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 
667 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 
708 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 
716 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 
693 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 
731 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 
731 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  36.2 
 
 
682 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 
656 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 
697 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 
744 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
663 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 
727 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 
718 aa  359  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
728 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 
656 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
690 aa  237  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.7 
 
 
653 aa  223  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 
678 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
669 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
665 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
651 aa  140  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.27 
 
 
646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 
634 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 
656 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.92 
 
 
663 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.54 
 
 
663 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.04 
 
 
666 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 
571 aa  91.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
736 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 
655 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  30.68 
 
 
666 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  30.68 
 
 
666 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  30.68 
 
 
666 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  30.68 
 
 
666 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  23.01 
 
 
673 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.93 
 
 
712 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
709 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  23.15 
 
 
671 aa  88.2  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 
663 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23.41 
 
 
671 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 
741 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 
737 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  26.38 
 
 
729 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  21.88 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.02 
 
 
693 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 
749 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  26.06 
 
 
707 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
613 aa  80.5  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 
767 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 
715 aa  80.5  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  21.95 
 
 
695 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.1 
 
 
698 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.58 
 
 
639 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 
581 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
695 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  21.26 
 
 
617 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  22.04 
 
 
696 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  23.04 
 
 
700 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 
688 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 
668 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 
681 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 
692 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 
677 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 
662 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
650 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
649 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  34.86 
 
 
677 aa  72  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 
792 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25 
 
 
707 aa  72  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  22.06 
 
 
628 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
657 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 
705 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  20.78 
 
 
641 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
1128 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  21.38 
 
 
656 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.1 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.55 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 
627 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.55 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  19.65 
 
 
634 aa  67.4  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  27.68 
 
 
646 aa  67.4  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 
762 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
737 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.01 
 
 
775 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
699 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.18 
 
 
650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.18 
 
 
650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 
649 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.04 
 
 
727 aa  64.7  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 
747 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>