117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1978 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 663 aa  1316    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.74 
 
 		 653 aa  147  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 693 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.79 
 
 		 675 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 665 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 651 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 667 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 685 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 669 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 675 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 657 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  21.04 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 668 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 699 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  19.33 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  20.48 
 
 		 656 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 744 aa  67.8  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  20.41 
 
 		 718 aa  67.8  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  19.37 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 708 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  23.27 
 
 		 651 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 695 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.93 
 
 		 639 aa  55.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 976 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  24.26 
 
 		 677 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 		 749 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  23.24 
 
 		 707 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 		 767 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 728 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 737 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 656 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  22.7 
 
 		 741 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 697 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  22.7 
 
 		 729 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.94 
 
 		 767 aa  51.2  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.94 
 
 		 767 aa  51.2  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.94 
 
 		 764 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.94 
 
 		 767 aa  51.2  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.94 
 
 		 718 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.94 
 
 		 769 aa  51.2  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 731 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.94 
 
 		 759 aa  51.2  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 731 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 638 aa  50.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 649 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 701 aa  50.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 642 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 642 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 635 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 642 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.22 
 
 		 704 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.45 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 751 aa  49.3  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 697 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 668 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 914 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 655 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.68 
 
 		 676 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 741 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  26.06 
 
 		 690 aa  47.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 673 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 709 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.23 
 
 		 680 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 615 aa  47.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  25.6 
 
 		 718 aa  47.4  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  30.89 
 
 		 853 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 853 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 853 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 841 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 686 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 853 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  34.02 
 
 		 750 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 799 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  38.89 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 824 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.9 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1128 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 713 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 787 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 737 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 732 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 747 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>