More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3462 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  100 
 
 
668 aa  1270    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 
666 aa  1150    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  94.46 
 
 
664 aa  1135    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  53.62 
 
 
649 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  54.75 
 
 
653 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  53.29 
 
 
649 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  53.12 
 
 
651 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 
613 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 
617 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29 
 
 
619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 
632 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
602 aa  111  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  24.28 
 
 
617 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
637 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
613 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
779 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
634 aa  104  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.09 
 
 
618 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 
628 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.96 
 
 
615 aa  102  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 
623 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  37.31 
 
 
628 aa  101  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
621 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 
747 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25.81 
 
 
638 aa  99.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 
597 aa  98.2  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
638 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
641 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  20.34 
 
 
641 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 
704 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.35 
 
 
623 aa  94.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 
627 aa  94.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.41 
 
 
614 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.41 
 
 
614 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  38.82 
 
 
614 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.82 
 
 
614 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.82 
 
 
614 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.82 
 
 
614 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.05 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 
639 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 
655 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
1128 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 
652 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  27.95 
 
 
631 aa  91.3  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.88 
 
 
1023 aa  91.3  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  31.15 
 
 
645 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 
686 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
628 aa  90.1  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
627 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
634 aa  89.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 
704 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.45 
 
 
631 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.87 
 
 
631 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  42.61 
 
 
616 aa  89  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
634 aa  88.6  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 
614 aa  88.6  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  44.2 
 
 
612 aa  87.4  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
626 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
626 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 
656 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.04 
 
 
616 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  37.04 
 
 
616 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.74 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.74 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.74 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 
792 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.74 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 
673 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 
634 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.74 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.06 
 
 
631 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 
615 aa  85.1  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.28 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.28 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
690 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
642 aa  84  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 
619 aa  83.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
705 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
617 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 
613 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  26 
 
 
624 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
614 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  36.48 
 
 
611 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 
735 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
692 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  33.74 
 
 
620 aa  80.9  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  39.84 
 
 
638 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 
618 aa  80.9  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  42.86 
 
 
631 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  33.74 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  33.61 
 
 
650 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.92 
 
 
646 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
627 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>