152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2998 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 799 aa  1611    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  99.87 
 
 		 824 aa  1609    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 768 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 768 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  27.71 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 768 aa  79  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 743 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  23.42 
 
 		 737 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 727 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  21.52 
 
 		 768 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 703 aa  57.4  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.93 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.12 
 
 		 728 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 724 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03469  Outer membrane protein  23.36 
 
 		 760 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 715 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 684 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 715 aa  55.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 769 aa  55.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 724 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 741 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 753 aa  55.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 714 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 730 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29.5 
 
 		 942 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.8 
 
 		 711 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 723 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.36 
 
 		 750 aa  54.3  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25 
 
 		 695 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 688 aa  54.3  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 651 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 711 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 751 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 788 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.87 
 
 		 713 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.87 
 
 		 713 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 809 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  26.46 
 
 		 810 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 790 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 787 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 790 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 720 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 798 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 727 aa  52  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 796 aa  52  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 775 aa  51.2  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 678 aa  51.2  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 721 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 716 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.7 
 
 		 640 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  26.55 
 
 		 550 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 780 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 791 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 721 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 711 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 773 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 706 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 773 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 706 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 791 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  22.01 
 
 		 712 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 771 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.97 
 
 		 914 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.9 
 
 		 647 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 720 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 411 aa  48.9  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 411 aa  48.9  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 735 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 829 aa  48.9  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 749 aa  48.9  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 753 aa  48.9  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 730 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 735 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 793 aa  48.5  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 780 aa  48.5  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 828 aa  48.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.98 
 
 		 633 aa  47.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 695 aa  47.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 710 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 736 aa  47.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  21.71 
 
 		 711 aa  47.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 728 aa  47.8  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 804 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 762 aa  47.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.44 
 
 		 755 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 896 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 761 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 732 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 787 aa  47.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 809 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 792 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>