More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6723 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1128 aa  2249    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 679 aa  201  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 688 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 707 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  26.99 
 
 		 633 aa  161  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  27.56 
 
 		 646 aa  156  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.36 
 
 		 656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 634 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 628 aa  154  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.07 
 
 		 639 aa  151  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.22 
 
 		 647 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 647 aa  150  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 		 668 aa  141  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.66 
 
 		 652 aa  138  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.32 
 
 		 613 aa  137  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 757 aa  136  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.16 
 
 		 616 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.78 
 
 		 631 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 618 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 593 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.45 
 
 		 665 aa  132  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 690 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.82 
 
 		 618 aa  129  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 602 aa  128  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 661 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 634 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 649 aa  125  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 657 aa  125  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  23.87 
 
 		 677 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.8 
 
 		 1023 aa  123  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.16 
 
 		 665 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 653 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.74 
 
 		 619 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 628 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 650 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 648 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 673 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 611 aa  120  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  27.74 
 
 		 620 aa  119  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 649 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.77 
 
 		 696 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.77 
 
 		 696 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 613 aa  118  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 641 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 662 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 617 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 616 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.55 
 
 		 630 aa  117  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.23 
 
 		 695 aa  116  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 662 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 680 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 697 aa  115  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 619 aa  114  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.78 
 
 		 631 aa  114  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 760 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 680 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 623 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.51 
 
 		 695 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 763 aa  113  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25.38 
 
 		 572 aa  112  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 621 aa  112  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.36 
 
 		 616 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 615 aa  111  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 799 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 681 aa  109  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 627 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.32 
 
 		 651 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  45.04 
 
 		 675 aa  107  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 626 aa  107  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  42.06 
 
 		 694 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3823  hypothetical protein  34.93 
 
 		 529 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000781142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 612 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 698 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 681 aa  105  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.19 
 
 		 661 aa  106  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 636 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 707 aa  105  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 750 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  30.67 
 
 		 631 aa  105  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 597 aa  105  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 626 aa  105  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 686 aa  104  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 799 aa  105  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 617 aa  104  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.43 
 
 		 622 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  34.48 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 611 aa  101  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1690  hypothetical protein  32.07 
 
 		 533 aa  101  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.095239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  41.67 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  41.67 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 709 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  41.67 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  27.49 
 
 		 611 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  41.67 
 
 		 659 aa  100  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  41.67 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  41.67 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  41.67 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>