More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6079 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  71.3 
 
 		 690 aa  1008    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  64.25 
 
 		 692 aa  890    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  65.84 
 
 		 695 aa  928    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 680 aa  1384    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  47.93 
 
 		 673 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  43.86 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  46.81 
 
 		 662 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  45.02 
 
 		 655 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  43.29 
 
 		 656 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 714 aa  346  8.999999999999999e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 634 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 642 aa  290  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.31 
 
 		 646 aa  282  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.83 
 
 		 638 aa  270  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 634 aa  250  7e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 670 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 645 aa  219  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 625 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 682 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 641 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 671 aa  194  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 618 aa  193  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.69 
 
 		 638 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 620 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 634 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 632 aa  174  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 617 aa  173  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 602 aa  170  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.67 
 
 		 628 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.36 
 
 		 1023 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 635 aa  163  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 627 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 593 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.28 
 
 		 615 aa  154  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 597 aa  154  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 641 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.64 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 617 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.64 
 
 		 614 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 616 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.47 
 
 		 614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.47 
 
 		 614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.3 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.22 
 
 		 631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.64 
 
 		 623 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.3 
 
 		 614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 611 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 627 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  27.32 
 
 		 611 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 624 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 624 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 638 aa  145  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.24 
 
 		 616 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 737 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.54 
 
 		 631 aa  143  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 629 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 611 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 627 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 698 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 628 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 624 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 626 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  25.84 
 
 		 623 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  28.41 
 
 		 621 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.93 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.09 
 
 		 613 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 627 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.16 
 
 		 680 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.92 
 
 		 630 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.67 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.59 
 
 		 615 aa  132  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.76 
 
 		 620 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.02 
 
 		 821 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.02 
 
 		 685 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.02 
 
 		 685 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 621 aa  126  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 632 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.85 
 
 		 685 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.85 
 
 		 685 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.85 
 
 		 685 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 697 aa  125  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  26.19 
 
 		 623 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.19 
 
 		 619 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.85 
 
 		 685 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 638 aa  124  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 698 aa  120  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  26.27 
 
 		 631 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.88 
 
 		 640 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 702 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>