More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4967 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1412    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 709 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 659 aa  127  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 634 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 680 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 634 aa  117  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 690 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.81 
 
 		 661 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  25.39 
 
 		 695 aa  107  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.29 
 
 		 696 aa  107  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.29 
 
 		 696 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 726 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.26 
 
 		 663 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  24.24 
 
 		 641 aa  105  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.61 
 
 		 680 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.78 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 737 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  35.39 
 
 		 613 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.05 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 621 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 1128 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 593 aa  99  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 626 aa  98.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 627 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.09 
 
 		 640 aa  98.2  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 652 aa  98.2  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 626 aa  98.2  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 681 aa  97.8  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 692 aa  97.8  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.4 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 628 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.01 
 
 		 695 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 698 aa  94.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  34.94 
 
 		 646 aa  93.6  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 613 aa  93.6  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 650 aa  93.6  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 699 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 617 aa  92.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.41 
 
 		 630 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.77 
 
 		 631 aa  92  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 670 aa  92  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  23.61 
 
 		 623 aa  91.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 655 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 715 aa  91.3  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 682 aa  90.5  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.92 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 642 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  31.87 
 
 		 638 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 618 aa  89.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 629 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  24.37 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.17 
 
 		 631 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  21.98 
 
 		 653 aa  88.6  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 714 aa  88.6  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 828 aa  87.8  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  43.64 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  43.64 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  43.64 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  43.64 
 
 		 641 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  43.64 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  43.64 
 
 		 659 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  43.64 
 
 		 663 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  43.22 
 
 		 884 aa  87.4  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 615 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 883 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 883 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 883 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  22.17 
 
 		 739 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 602 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  42.73 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  42.73 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  42.73 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  42.73 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  42.73 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.37 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 901 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.4 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.16 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.89 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 698 aa  84.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.16 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 665 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.53 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.13 
 
 		 1023 aa  84.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.16 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.53 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.53 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.56 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 799 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 849 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  22.05 
 
 		 640 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.88 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  39.33 
 
 		 707 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  27.88 
 
 		 666 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>