More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2402 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  100 
 
 		 611 aa  1200    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  97.22 
 
 		 611 aa  1160    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 655 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 645 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  31.41 
 
 		 638 aa  243  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 634 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 634 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 641 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.56 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 634 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 682 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 618 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 		 671 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 632 aa  193  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.23 
 
 		 613 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 647 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 670 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 642 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 593 aa  190  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 625 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 635 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.25 
 
 		 617 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 673 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 662 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.84 
 
 		 619 aa  171  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 695 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 692 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 626 aa  167  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  28.22 
 
 		 614 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 616 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.44 
 
 		 646 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  27.09 
 
 		 611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 640 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 655 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.9 
 
 		 616 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.59 
 
 		 638 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 627 aa  156  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 656 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 690 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 617 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 614 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 641 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 620 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.87 
 
 		 631 aa  147  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 680 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 602 aa  147  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  28.42 
 
 		 652 aa  146  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.84 
 
 		 615 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.39 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.39 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.39 
 
 		 614 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 611 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 623 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.83 
 
 		 1023 aa  144  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.23 
 
 		 614 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.11 
 
 		 614 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.57 
 
 		 645 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.33 
 
 		 614 aa  142  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.33 
 
 		 614 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.33 
 
 		 614 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.83 
 
 		 616 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.33 
 
 		 614 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.17 
 
 		 614 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.49 
 
 		 614 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 659 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 613 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 634 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.83 
 
 		 620 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 697 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 698 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 637 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 648 aa  134  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 628 aa  134  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 714 aa  133  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 632 aa  133  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.83 
 
 		 623 aa  131  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 742 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  27.99 
 
 		 631 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  26.02 
 
 		 663 aa  127  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.99 
 
 		 650 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.59 
 
 		 663 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.81 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 638 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.53 
 
 		 613 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.54 
 
 		 640 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.93 
 
 		 631 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.31 
 
 		 631 aa  123  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.64 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.64 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>