More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1245 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 636 aa  1305    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  49.76 
 
 		 652 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  50 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  41.55 
 
 		 650 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  38.29 
 
 		 627 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  40.49 
 
 		 618 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  41.47 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 615 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  40.33 
 
 		 626 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 616 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 619 aa  270  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 621 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 634 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 647 aa  127  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 665 aa  127  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 648 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 669 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 657 aa  120  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.02 
 
 		 639 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.26 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 702 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.04 
 
 		 623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.19 
 
 		 653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 634 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.96 
 
 		 661 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 695 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.54 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.29 
 
 		 641 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.28 
 
 		 663 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.28 
 
 		 663 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.62 
 
 		 663 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.62 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.62 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.69 
 
 		 646 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.16 
 
 		 659 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.63 
 
 		 744 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 682 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.69 
 
 		 615 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.25 
 
 		 744 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 1128 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 692 aa  100  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 602 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.59 
 
 		 650 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.98 
 
 		 744 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.23 
 
 		 650 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.23 
 
 		 650 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.23 
 
 		 650 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.23 
 
 		 650 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 652 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 651 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 710 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 677 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.81 
 
 		 681 aa  95.5  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.49 
 
 		 614 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 690 aa  95.1  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 733 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 643 aa  94.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 678 aa  94.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 625 aa  94.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 679 aa  94.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 627 aa  93.6  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  22.92 
 
 		 746 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 613 aa  93.6  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.05 
 
 		 656 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.14 
 
 		 651 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.69 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.69 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  22.54 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.79 
 
 		 698 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 571 aa  92  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 665 aa  91.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.88 
 
 		 693 aa  91.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.51 
 
 		 688 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.56 
 
 		 1023 aa  90.9  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 653 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 653 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.5 
 
 		 631 aa  90.5  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 628 aa  90.5  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 653 aa  90.5  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 634 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.36 
 
 		 623 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 653 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 653 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  23.25 
 
 		 638 aa  88.6  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  22.01 
 
 		 688 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 709 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 640 aa  89  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  24.25 
 
 		 659 aa  89  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  23.19 
 
 		 628 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 659 aa  88.2  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.36 
 
 		 653 aa  87.8  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 653 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>