More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2900 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 609 aa  1239    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  47.76 
 
 		 626 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  46.56 
 
 		 615 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  48.13 
 
 		 616 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  44.28 
 
 		 618 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  42.72 
 
 		 627 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  40.75 
 
 		 636 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  41.2 
 
 		 621 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  41.16 
 
 		 652 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  39.66 
 
 		 593 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  41.86 
 
 		 650 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  36.88 
 
 		 621 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 619 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 613 aa  115  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 634 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.83 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.96 
 
 		 615 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  32.72 
 
 		 659 aa  94.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.34 
 
 		 623 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 653 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 634 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.15 
 
 		 615 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.33 
 
 		 650 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.33 
 
 		 631 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.57 
 
 		 631 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 686 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.71 
 
 		 631 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.17 
 
 		 650 aa  90.5  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.29 
 
 		 653 aa  90.5  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.17 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  23.37 
 
 		 611 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.33 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.17 
 
 		 650 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 		 659 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 653 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.68 
 
 		 633 aa  88.2  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.94 
 
 		 631 aa  88.2  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  38.41 
 
 		 613 aa  88.2  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.32 
 
 		 659 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 653 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.14 
 
 		 663 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.32 
 
 		 641 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.14 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.14 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.96 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.96 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 665 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  36.69 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 699 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.02 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 623 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  29.87 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 624 aa  84  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.45 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.23 
 
 		 618 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 618 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.4 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  23.11 
 
 		 623 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  33.57 
 
 		 645 aa  81.6  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 628 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 682 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 653 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 652 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 656 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  34.81 
 
 		 651 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.72 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.72 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 783 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 680 aa  78.2  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 707 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 634 aa  77.4  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 613 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 602 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  28.57 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>