More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0621 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
713 aa  1473    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  39.42 
 
 
799 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 
791 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  39.2 
 
 
797 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 
772 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 
792 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 
798 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  32.13 
 
 
782 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 
1117 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 
781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  28.33 
 
 
960 aa  270  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 
763 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  27.61 
 
 
767 aa  248  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 
788 aa  247  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 
823 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 
631 aa  92  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 
634 aa  92  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.13 
 
 
646 aa  87.4  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 
617 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
616 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 
617 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.05 
 
 
619 aa  84  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  33.33 
 
 
638 aa  84  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.5 
 
 
631 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 
750 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 
678 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  34.51 
 
 
593 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.65 
 
 
631 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 
628 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.11 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 
637 aa  78.2  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.81 
 
 
618 aa  78.2  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 
698 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  33.13 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 
760 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.84 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.8 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.32 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  30.5 
 
 
627 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 
653 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 
642 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.32 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
619 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 
659 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 
609 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  21.19 
 
 
642 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 
613 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.32 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.32 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.87 
 
 
615 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
627 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  31.51 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.24 
 
 
653 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  38.06 
 
 
612 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.32 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 
651 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.23 
 
 
631 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.99 
 
 
615 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
621 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 
653 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  29.61 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 
686 aa  73.9  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
653 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  33.87 
 
 
628 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.94 
 
 
616 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
688 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 
642 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 
624 aa  73.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  27.66 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  27.66 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  30.77 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 
649 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  30.77 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  30.77 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.46 
 
 
623 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  30.77 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  30.77 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  27.66 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  27.66 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  27.66 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.66 
 
 
659 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 
593 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 
653 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  22.95 
 
 
645 aa  72  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  34.97 
 
 
650 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.56 
 
 
1023 aa  71.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 
737 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  31.34 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 
753 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  28.11 
 
 
631 aa  71.2  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  28.75 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 
664 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>