More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1964 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 618 aa  1261    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  49.44 
 
 		 621 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  45.41 
 
 		 615 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  44.19 
 
 		 616 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  44.94 
 
 		 609 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  45.45 
 
 		 621 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  44.26 
 
 		 619 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  41.94 
 
 		 627 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  40.59 
 
 		 593 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  40.49 
 
 		 636 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  38.84 
 
 		 650 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  40.81 
 
 		 626 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  37.08 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.82 
 
 		 633 aa  107  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.88 
 
 		 653 aa  100  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 653 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 653 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 652 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 653 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  33.05 
 
 		 659 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 653 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 686 aa  94  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.26 
 
 		 639 aa  93.6  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 653 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 665 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 634 aa  92.8  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 653 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 653 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 659 aa  91.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  31.62 
 
 		 656 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.2 
 
 		 653 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 		 617 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 656 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 710 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  32.96 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.28 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 615 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  32.73 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 670 aa  83.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 661 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 673 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.61 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.82 
 
 		 631 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.48 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 849 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.48 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 692 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  31.32 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 		 695 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.82 
 
 		 631 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  24.19 
 
 		 650 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  30.98 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.26 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  30.94 
 
 		 618 aa  77  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 634 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  30.34 
 
 		 614 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 613 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.98 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 625 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 653 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  29.82 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  28.9 
 
 		 638 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 		 613 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.69 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.92 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.77 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 680 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 		 668 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.92 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.92 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.92 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 613 aa  74.7  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.3 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.91 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 662 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>