More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3052 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 753 aa  1545    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  55.06 
 
 		 748 aa  853    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  53.6 
 
 		 760 aa  791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  58.31 
 
 		 750 aa  891    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 745 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 751 aa  197  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 773 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 668 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.35 
 
 		 833 aa  179  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 778 aa  174  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 772 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 763 aa  167  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.26 
 
 		 848 aa  160  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 719 aa  143  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  24.8 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 634 aa  130  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 721 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 613 aa  123  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.49 
 
 		 640 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 653 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  21.52 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 653 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 661 aa  114  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.93 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.65 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 757 aa  112  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 662 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 649 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 720 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.14 
 
 		 633 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 720 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 662 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 680 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 635 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.51 
 
 		 653 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  23.88 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 687 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 715 aa  104  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.62 
 
 		 656 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 652 aa  102  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 698 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.64 
 
 		 739 aa  99.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.25 
 
 		 650 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 828 aa  98.2  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.25 
 
 		 650 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.05 
 
 		 650 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.7 
 
 		 651 aa  97.8  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 707 aa  97.4  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.16 
 
 		 650 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 713 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 691 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.26 
 
 		 650 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 747 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 719 aa  95.1  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 658 aa  94.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 649 aa  94  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  39.29 
 
 		 704 aa  94.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 647 aa  94.4  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 426 aa  94  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 918 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.95 
 
 		 661 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.43 
 
 		 641 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.46 
 
 		 652 aa  93.6  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.35 
 
 		 744 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.83 
 
 		 744 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.98 
 
 		 744 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.05 
 
 		 655 aa  93.2  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  23.84 
 
 		 652 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 697 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.43 
 
 		 663 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 668 aa  90.5  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.43 
 
 		 663 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 798 aa  90.5  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 680 aa  90.9  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.43 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.21 
 
 		 659 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 788 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 818 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.87 
 
 		 647 aa  90.5  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.43 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.43 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  24.44 
 
 		 746 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  39.55 
 
 		 700 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.2 
 
 		 646 aa  89  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 694 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 772 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.84 
 
 		 631 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.45 
 
 		 631 aa  88.2  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  25.22 
 
 		 676 aa  87.8  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  25.59 
 
 		 593 aa  87.4  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  23.14 
 
 		 799 aa  87.8  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  23.38 
 
 		 611 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>