More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4269 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  57.48 
 
 
791 aa  948    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
797 aa  1622    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  51.74 
 
 
799 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  50.76 
 
 
772 aa  770    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  39.16 
 
 
798 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  39.2 
 
 
713 aa  476  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  36.22 
 
 
782 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 
792 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 
1117 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  29.28 
 
 
767 aa  331  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 
781 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 
823 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  28.04 
 
 
960 aa  297  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 
763 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.01 
 
 
788 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 
760 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.8 
 
 
833 aa  97.8  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 
748 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 
776 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
795 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
833 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
785 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
778 aa  84  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 
805 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
938 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 
750 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
866 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
814 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 
932 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 
1081 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 
988 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
836 aa  78.2  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 
753 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  21.47 
 
 
848 aa  76.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 
824 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
917 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
821 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 
698 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
810 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
653 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 
1082 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
943 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
780 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 
805 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 
957 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 
781 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 
776 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  31.15 
 
 
659 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
763 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
845 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 
975 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 
872 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 
783 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 
747 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
791 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
793 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 
721 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 
686 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.46 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.12 
 
 
685 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.12 
 
 
685 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.12 
 
 
685 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 
1001 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.31 
 
 
685 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 
621 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
882 aa  67.8  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.12 
 
 
685 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 
1189 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 
1073 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 
828 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.06 
 
 
653 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
763 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
653 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
653 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
653 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.83 
 
 
617 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 
649 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
821 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  24.66 
 
 
891 aa  66.6  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.08 
 
 
638 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.31 
 
 
821 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
780 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
791 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
1049 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  33.33 
 
 
653 aa  65.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.92 
 
 
685 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
815 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.73 
 
 
680 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
668 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
697 aa  65.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  25.4 
 
 
1032 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
757 aa  65.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
808 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 
649 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
720 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 
924 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 
664 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
666 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>