More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3613 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 664 aa  1263    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  93.57 
 
 		 668 aa  1132    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  97.75 
 
 		 666 aa  1187    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  55.08 
 
 		 653 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  53.78 
 
 		 649 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  52.88 
 
 		 649 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  52.38 
 
 		 651 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 667 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.67 
 
 		 613 aa  128  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  23.58 
 
 		 617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 709 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 779 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 632 aa  107  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 637 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.43 
 
 		 615 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 602 aa  104  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.98 
 
 		 619 aa  104  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.32 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  37.31 
 
 		 628 aa  99.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 627 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 617 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 747 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1128 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 597 aa  95.5  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.69 
 
 		 614 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.69 
 
 		 614 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 704 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 627 aa  94.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40 
 
 		 614 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40 
 
 		 614 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  40 
 
 		 614 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40 
 
 		 614 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 612 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 762 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  35.48 
 
 		 628 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 641 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.79 
 
 		 623 aa  91.3  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 638 aa  91.3  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.88 
 
 		 1023 aa  90.9  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  20.38 
 
 		 641 aa  90.9  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.38 
 
 		 631 aa  90.9  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  33.91 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 615 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.21 
 
 		 611 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 704 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 624 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 690 aa  89  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 688 aa  87.8  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  42.61 
 
 		 616 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 614 aa  87.4  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 611 aa  87.4  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 626 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 626 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 616 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.06 
 
 		 631 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.25 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  36.96 
 
 		 616 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.68 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.28 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.28 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.67 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 656 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 662 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 634 aa  84  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.96 
 
 		 646 aa  84  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  30.74 
 
 		 659 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  26.81 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  39.16 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 697 aa  81.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  35.97 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  42.86 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  33.33 
 
 		 620 aa  81.3  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 735 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  33.14 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 624 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 680 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 593 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  44.44 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 692 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>