More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3572 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
653 aa  1256    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  54.59 
 
 
666 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  54.75 
 
 
664 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  54.46 
 
 
668 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  50.57 
 
 
649 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  49.84 
 
 
649 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  49.08 
 
 
651 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 
667 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 
613 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
642 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
642 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
638 aa  104  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
735 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.03 
 
 
619 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
638 aa  97.8  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
798 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.05 
 
 
615 aa  97.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.09 
 
 
616 aa  94.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
642 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
642 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
642 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
602 aa  94.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  33.81 
 
 
960 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.51 
 
 
653 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.85 
 
 
1023 aa  91.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  22.63 
 
 
611 aa  91.3  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.47 
 
 
671 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.1 
 
 
614 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.85 
 
 
614 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.54 
 
 
616 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.1 
 
 
618 aa  88.2  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
709 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.67 
 
 
614 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.67 
 
 
614 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.81 
 
 
614 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
617 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  29.82 
 
 
788 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.41 
 
 
616 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.67 
 
 
614 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 
634 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
627 aa  87  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
665 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  27.39 
 
 
661 aa  85.1  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  19.3 
 
 
607 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 
659 aa  84.3  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  20 
 
 
641 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 
597 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.46 
 
 
646 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
792 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 
673 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
621 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 
611 aa  81.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
571 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 
713 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  26.52 
 
 
767 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 
636 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 
698 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.7 
 
 
799 aa  79.7  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.65 
 
 
623 aa  78.2  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
632 aa  78.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 
686 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  37.27 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 
618 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.72 
 
 
631 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.12 
 
 
690 aa  77.4  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.62 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.93 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.93 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.53 
 
 
633 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 
637 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.93 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
704 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.93 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 
678 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  37.66 
 
 
628 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 
692 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 
781 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 
634 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 
623 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 
797 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  35.33 
 
 
620 aa  75.5  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 
686 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  20 
 
 
647 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 
791 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  35.33 
 
 
697 aa  75.1  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
629 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  27.53 
 
 
677 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
657 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 
677 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  42.99 
 
 
628 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.12 
 
 
631 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  26.85 
 
 
782 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  25.48 
 
 
626 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 
718 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 
763 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
625 aa  73.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
618 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>