More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2896 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  55.06 
 
 		 683 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  67.69 
 
 		 678 aa  908    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  52.45 
 
 		 693 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 686 aa  1398    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  81.49 
 
 		 709 aa  1159    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  62.02 
 
 		 667 aa  830    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  54.97 
 
 		 683 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  55.25 
 
 		 683 aa  775    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  55.44 
 
 		 683 aa  772    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  42.14 
 
 		 681 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  41.6 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 687 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.15 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  31.54 
 
 		 656 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 742 aa  87  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 682 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.34 
 
 		 704 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 675 aa  81.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 696 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.44 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  22.09 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.23 
 
 		 716 aa  77.8  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.08 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 715 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 781 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  20.77 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 656 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 704 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 700 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 704 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 733 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 736 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 709 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 710 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 731 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  23.55 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 736 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.23 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 734 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.07 
 
 		 646 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 698 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 713 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 728 aa  71.2  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 742 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.36 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 717 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.36 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 688 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.11 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.78 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 715 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.22 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 779 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.22 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 638 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.22 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 723 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  20.45 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  26.67 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  21.61 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.58 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  21.13 
 
 		 693 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  21.52 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  21.87 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  20.52 
 
 		 760 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  21.51 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.71 
 
 		 724 aa  64.3  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 700 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 700 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 710 aa  63.9  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 704 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>