More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0836 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  55.25 
 
 		 686 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  97.36 
 
 		 683 aa  1358    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  56.93 
 
 		 709 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  54.26 
 
 		 678 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  100 
 
 		 683 aa  1399    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  62.38 
 
 		 667 aa  810    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  46.66 
 
 		 683 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  46.85 
 
 		 693 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  46.26 
 
 		 683 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  38.8 
 
 		 681 aa  439  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.09 
 
 		 692 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 688 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 710 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 687 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 706 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 694 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  21.12 
 
 		 725 aa  84  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 736 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 731 aa  80.9  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.73 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 659 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  28.52 
 
 		 712 aa  73.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.71 
 
 		 712 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.72 
 
 		 716 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 652 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  22.27 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 653 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 728 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 684 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.65 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  19.8 
 
 		 708 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 726 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.86 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.86 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 733 aa  67.8  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.7 
 
 		 727 aa  67.4  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.75 
 
 		 653 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.91 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.86 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.74 
 
 		 721 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 742 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  27.89 
 
 		 787 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 781 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 708 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 713 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  31.49 
 
 		 775 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  21.65 
 
 		 770 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 736 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  21.65 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 715 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 597 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 718 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 737 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 710 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 678 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.02 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  20.21 
 
 		 634 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 681 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 709 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 769 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 664 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  21.54 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>