More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  66.23 
 
 
681 aa  912    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  100 
 
 
678 aa  1372    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 
714 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 
736 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  37.69 
 
 
727 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 
742 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 
715 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 
737 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 
681 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  36.58 
 
 
717 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 
698 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  35.72 
 
 
700 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 
726 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 
713 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 
734 aa  365  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 
702 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 
716 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 
733 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 
706 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 
692 aa  350  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 
664 aa  334  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  33.76 
 
 
712 aa  302  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 
718 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
708 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 
740 aa  290  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  32.18 
 
 
715 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 
690 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 
688 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  33.38 
 
 
690 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 
720 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 
739 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 
786 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 
787 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 
702 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
785 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 
712 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
800 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 
675 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
688 aa  157  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 
691 aa  150  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
680 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
700 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
770 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
700 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 
728 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
723 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.9 
 
 
712 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.89 
 
 
700 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.89 
 
 
700 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 
697 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
694 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.3 
 
 
726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.15 
 
 
706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 
701 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25 
 
 
706 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25 
 
 
706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.85 
 
 
706 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.85 
 
 
721 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
706 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 
705 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
715 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
731 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.99 
 
 
701 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  20.99 
 
 
705 aa  107  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 
720 aa  107  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
688 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.83 
 
 
762 aa  102  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 
700 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 
757 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 
681 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 
742 aa  98.2  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
688 aa  97.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 
778 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
706 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  21.42 
 
 
690 aa  94  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.52 
 
 
710 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 
736 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 
791 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 
780 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  21.69 
 
 
711 aa  87.4  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  22.53 
 
 
797 aa  86.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  20.39 
 
 
698 aa  85.9  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
682 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  23.46 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.94 
 
 
743 aa  84.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
723 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 
791 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 
703 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
776 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 
774 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.2 
 
 
696 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.48 
 
 
680 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>