260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2605 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  47.76 
 
 		 813 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  100 
 
 		 787 aa  1598    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 770 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 741 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 		 769 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  34.62 
 
 		 935 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 822 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 778 aa  439  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 801 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 777 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 777 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 777 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 788 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  31.51 
 
 		 741 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 773 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 824 aa  344  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 781 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 779 aa  333  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  31.11 
 
 		 797 aa  323  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 873 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 802 aa  321  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 760 aa  317  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 873 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 772 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 775 aa  298  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 805 aa  292  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 821 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 848 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 825 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 825 aa  282  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 841 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 839 aa  280  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 856 aa  280  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 839 aa  280  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 826 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 825 aa  271  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 868 aa  256  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 807 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 821 aa  244  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 1188 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  41.07 
 
 		 317 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  24.42 
 
 		 775 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.98 
 
 		 712 aa  95.1  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 742 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 681 aa  90.9  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 723 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 710 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 728 aa  85.9  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.13 
 
 		 712 aa  84  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 678 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 705 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 737 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 686 aa  77.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 683 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 705 aa  74.7  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  21.06 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  22.08 
 
 		 683 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 757 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.46 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 828 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.46 
 
 		 726 aa  67  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 683 aa  67.4  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  22.89 
 
 		 691 aa  67.4  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  27.89 
 
 		 683 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  24 
 
 		 713 aa  64.3  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 533 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 671 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.67 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 697 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  20.64 
 
 		 734 aa  62  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  20.51 
 
 		 693 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  27.83 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  21.23 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 709 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 694 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  28.71 
 
 		 720 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 714 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>