More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5125 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  68.19 
 
 		 801 aa  1047    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1569    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  75.14 
 
 		 788 aa  1138    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  98.33 
 
 		 777 aa  1546    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1569    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  41.88 
 
 		 778 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 769 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 		 822 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 		 741 aa  522  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 873 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  36.87 
 
 		 741 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 873 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  34.31 
 
 		 797 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 813 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 779 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 770 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 824 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 773 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  31.52 
 
 		 935 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 772 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 802 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  34.22 
 
 		 787 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 848 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 781 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 841 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 839 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 825 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 825 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 856 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 821 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 760 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 825 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 826 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 775 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 868 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 805 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 807 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 821 aa  320  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  41.28 
 
 		 1188 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.07 
 
 		 775 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  48.04 
 
 		 317 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 688 aa  124  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 706 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.82 
 
 		 710 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 742 aa  112  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 709 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 720 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 726 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.03 
 
 		 706 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.03 
 
 		 706 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.03 
 
 		 706 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 699 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 681 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 671 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.76 
 
 		 706 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 757 aa  99.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 700 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 675 aa  97.4  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 699 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.28 
 
 		 727 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 730 aa  97.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  21.8 
 
 		 726 aa  96.3  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 694 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 715 aa  94.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 652 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  22.11 
 
 		 652 aa  94  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 697 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.27 
 
 		 639 aa  93.2  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 698 aa  91.3  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 705 aa  90.9  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 688 aa  90.5  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.31 
 
 		 653 aa  88.6  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 720 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 653 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 653 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 		 653 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 742 aa  87.8  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 653 aa  87.4  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 653 aa  87.4  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 653 aa  87.4  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 778 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 720 aa  84.7  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 728 aa  84  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  28.41 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  28.41 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 703 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.53 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>