52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2031 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
317 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  58.76 
 
 
935 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  50.23 
 
 
1188 aa  242  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  52.79 
 
 
769 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  47.47 
 
 
778 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  43.52 
 
 
741 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  48.39 
 
 
741 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 
777 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  50 
 
 
822 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  48.04 
 
 
777 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  48.04 
 
 
777 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  47.46 
 
 
779 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  46.84 
 
 
788 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  43.5 
 
 
873 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  43 
 
 
873 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  46.63 
 
 
801 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  49.07 
 
 
773 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  36.76 
 
 
797 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  40.99 
 
 
770 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  45.95 
 
 
787 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  47.5 
 
 
781 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  40.86 
 
 
813 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  41.49 
 
 
824 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 
802 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 
775 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 
841 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 
839 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 
839 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 
821 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 
805 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 
825 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 
825 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  41.82 
 
 
848 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  41.72 
 
 
826 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 
825 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 
821 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 
760 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 
772 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 
856 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 
868 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 
807 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
732 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
720 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 
867 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.2 
 
 
653 aa  45.8  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.92 
 
 
686 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  30 
 
 
757 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 
730 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 
736 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 
742 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  27.33 
 
 
713 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 
647 aa  42.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>