263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0955 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  47.17 
 
 		 825 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  47.41 
 
 		 821 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  52.3 
 
 		 807 aa  791    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  43.58 
 
 		 797 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  46.77 
 
 		 825 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  43.55 
 
 		 848 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  47.17 
 
 		 825 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  45.89 
 
 		 826 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  61.07 
 
 		 805 aa  988    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  43.3 
 
 		 868 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  52.78 
 
 		 824 aa  819    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 802 aa  1632    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 856 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 839 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 		 839 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 		 841 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 775 aa  459  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 772 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  34.74 
 
 		 741 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 760 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 769 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 821 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 788 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 777 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 777 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 777 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 741 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 778 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 801 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 781 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 822 aa  345  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 773 aa  336  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 779 aa  318  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  30.04 
 
 		 787 aa  316  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 813 aa  308  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 873 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 770 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 873 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  29.62 
 
 		 935 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  26.45 
 
 		 775 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1188 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  36.22 
 
 		 317 aa  147  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 715 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 702 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 702 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.94 
 
 		 716 aa  64.7  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 709 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 694 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 821 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 715 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 747 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  24.7 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  27.69 
 
 		 706 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.96 
 
 		 631 aa  56.6  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  27.18 
 
 		 706 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 747 aa  56.6  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  27.18 
 
 		 706 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  27.18 
 
 		 721 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  27.18 
 
 		 706 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 702 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 742 aa  57  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 728 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 700 aa  55.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 704 aa  55.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.64 
 
 		 712 aa  55.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 757 aa  55.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 688 aa  55.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 679 aa  55.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 769 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 506 aa  54.7  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 711 aa  54.3  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.23 
 
 		 676 aa  54.3  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 705 aa  54.3  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 709 aa  54.3  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 618 aa  54.3  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 757 aa  54.3  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 780 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 638 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.26 
 
 		 692 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 716 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 		 751 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 736 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>