257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1492 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 711 aa  1449    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  99.8 
 
 		 506 aa  1002    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  99.56 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 735 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 735 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 760 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 765 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 738 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 738 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  20.69 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 721 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  20.32 
 
 		 729 aa  80.1  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 786 aa  77.4  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 809 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 703 aa  70.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 700 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 700 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 700 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.96 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.96 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.35 
 
 		 774 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 693 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 774 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  27.32 
 
 		 760 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.09 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.09 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 782 aa  65.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  24.72 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  24.92 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.72 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  24.72 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 841 aa  64.3  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  28.38 
 
 		 760 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 736 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 723 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 708 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 742 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  27.87 
 
 		 640 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 754 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 754 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.15 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  25.75 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 848 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 720 aa  60.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.43 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  20 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  25.51 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 725 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.83 
 
 		 782 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 737 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 868 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  29.52 
 
 		 706 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 742 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.33 
 
 		 685 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 710 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 706 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.07 
 
 		 711 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 835 aa  55.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  28.92 
 
 		 706 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 		 791 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  28.92 
 
 		 721 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  28.92 
 
 		 706 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  28.92 
 
 		 706 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 689 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.92 
 
 		 685 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 777 aa  54.3  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 801 aa  54.3  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.92 
 
 		 821 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 802 aa  54.3  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 725 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.92 
 
 		 685 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.92 
 
 		 685 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.92 
 
 		 685 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 681 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>