More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5661 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  73.99 
 
 		 774 aa  1112    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  70.05 
 
 		 778 aa  1053    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  52.51 
 
 		 791 aa  757    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 769 aa  1538    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  53.54 
 
 		 791 aa  763    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  72.23 
 
 		 776 aa  1113    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  72.16 
 
 		 776 aa  1108    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  51.54 
 
 		 797 aa  713    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 688 aa  146  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.84 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 726 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 692 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 709 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 715 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 702 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 700 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 728 aa  117  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 705 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.33 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 734 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.33 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 700 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 731 aa  114  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 678 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 700 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 681 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 701 aa  111  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 723 aa  111  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.83 
 
 		 706 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 688 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.25 
 
 		 721 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.11 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 675 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.11 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.45 
 
 		 712 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.96 
 
 		 706 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 708 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  26.23 
 
 		 743 aa  106  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 681 aa  105  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 736 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.97 
 
 		 710 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 706 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 697 aa  98.2  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  25.35 
 
 		 690 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.92 
 
 		 712 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  27.78 
 
 		 727 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 717 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  24.18 
 
 		 715 aa  94.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 680 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 715 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 716 aa  89  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 713 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 733 aa  85.1  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 742 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 723 aa  80.9  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 682 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 701 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 690 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 714 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 785 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 856 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  31.17 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 807 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 780 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 736 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 718 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 742 aa  65.1  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  25.3 
 
 		 670 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23.28 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 698 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 687 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 697 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 743 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 666 aa  61.6  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>