More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0571 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  66.06 
 
 		 776 aa  1016    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 778 aa  1557    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  56.86 
 
 		 791 aa  785    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  53.33 
 
 		 791 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  66.58 
 
 		 774 aa  1003    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  70.05 
 
 		 769 aa  1051    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  66.45 
 
 		 776 aa  1008    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  53.82 
 
 		 797 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 692 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 726 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 717 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 702 aa  130  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 700 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 700 aa  127  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 688 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 700 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 700 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 700 aa  125  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 700 aa  124  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.98 
 
 		 700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.98 
 
 		 700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 700 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 715 aa  121  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 709 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.82 
 
 		 721 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 728 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.68 
 
 		 706 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.68 
 
 		 706 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.68 
 
 		 706 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.68 
 
 		 706 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 785 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.92 
 
 		 701 aa  107  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 675 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 690 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 736 aa  105  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 700 aa  104  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  24.92 
 
 		 690 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 734 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.52 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 718 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 715 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 708 aa  99  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 787 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  33.68 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 701 aa  96.3  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 678 aa  94  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  23.19 
 
 		 715 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 723 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 737 aa  91.3  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 713 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 742 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 698 aa  89  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 740 aa  83.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 716 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.8 
 
 		 743 aa  82.4  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 780 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 800 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 731 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 856 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 868 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 698 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 656 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 733 aa  72  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 655 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  30.74 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  24.96 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  19.97 
 
 		 688 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 784 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 785 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 785 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  22.52 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  22.38 
 
 		 727 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.67 
 
 		 681 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.64 
 
 		 630 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.64 
 
 		 630 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 687 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.86 
 
 		 617 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.62 
 
 		 712 aa  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 742 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>