More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0732 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  48.83 
 
 		 682 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1411    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  51.92 
 
 		 680 aa  634  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  38.07 
 
 		 703 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 690 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 770 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 780 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 696 aa  230  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  25.69 
 
 		 762 aa  207  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 675 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 688 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 678 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  22.8 
 
 		 691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 715 aa  127  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 728 aa  123  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.67 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.81 
 
 		 721 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.53 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.53 
 
 		 706 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.53 
 
 		 706 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 731 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 709 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 700 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 720 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 700 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 700 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.14 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.14 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 700 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 715 aa  111  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 681 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 706 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 706 aa  110  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 717 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 701 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 694 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 710 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 700 aa  107  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 742 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 681 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 726 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 723 aa  96.3  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23.77 
 
 		 797 aa  95.1  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.06 
 
 		 712 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.64 
 
 		 712 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 723 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 736 aa  91.3  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 678 aa  90.9  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 737 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 742 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 697 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  31.74 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  20.66 
 
 		 716 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 		 733 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  20.13 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  19.8 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 702 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.37 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.5 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  21.19 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  20.26 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 791 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  21.93 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  20.75 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  20.45 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  20.59 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 675 aa  70.5  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 705 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  21.19 
 
 		 736 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 666 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  20 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  20.83 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 690 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.71 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.71 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 776 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 776 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  22.4 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>