182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2688 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 720 aa  1437    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 739 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 678 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 742 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 726 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 737 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 785 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 681 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 786 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 787 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 736 aa  235  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  30.08 
 
 		 727 aa  231  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 715 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 717 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 713 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 688 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 714 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 690 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 716 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 681 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  29.27 
 
 		 712 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  29.2 
 
 		 690 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 718 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 712 aa  195  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 706 aa  191  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 702 aa  187  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 692 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 708 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  33.56 
 
 		 715 aa  114  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 700 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 709 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 778 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 682 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 800 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 741 aa  98.2  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 688 aa  98.2  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 702 aa  97.8  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 706 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 728 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 723 aa  95.1  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 710 aa  94  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 742 aa  94  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 705 aa  91.3  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.25 
 
 		 691 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.01 
 
 		 700 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.01 
 
 		 700 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.19 
 
 		 721 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.89 
 
 		 706 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.89 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.35 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.89 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 776 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 774 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 777 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 788 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 731 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 801 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 697 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 770 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 705 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.41 
 
 		 726 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 780 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 715 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 678 aa  64.7  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.92 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  30.7 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  28.17 
 
 		 683 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 770 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>