More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02129 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  50.61 
 
 		 683 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  62.38 
 
 		 683 aa  810    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  58.67 
 
 		 678 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  62.07 
 
 		 683 aa  805    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  62.02 
 
 		 686 aa  830    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  51.07 
 
 		 683 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  62.29 
 
 		 709 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 667 aa  1343    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  48.64 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  41.14 
 
 		 681 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 688 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 652 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 656 aa  97.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  26.76 
 
 		 692 aa  95.1  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 687 aa  94.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 656 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 708 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 688 aa  87  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 653 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  25.67 
 
 		 659 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 681 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 675 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.88 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 705 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  22.73 
 
 		 725 aa  78.2  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 653 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  25.05 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 742 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 728 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.7 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 711 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 736 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 704 aa  67.4  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 681 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.81 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 704 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.81 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 704 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.83 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 678 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.81 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.94 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  20.17 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.35 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 713 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  19.35 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  20.83 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.53 
 
 		 726 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 710 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 704 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.1 
 
 		 680 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.46 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  22.85 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  29.63 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  27.01 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  19.62 
 
 		 690 aa  61.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 709 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  34.23 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 708 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  20.7 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 684 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 779 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>