More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3112 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 687 aa  1398    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 688 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 681 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 733 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 678 aa  137  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 686 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  28.63 
 
 		 743 aa  132  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  30.83 
 
 		 716 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  23.93 
 
 		 693 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 704 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 704 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  28.12 
 
 		 692 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 683 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 760 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 709 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 697 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  23.59 
 
 		 683 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 723 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  24.38 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 734 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  24.22 
 
 		 683 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 694 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 736 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 667 aa  107  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 681 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 683 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 750 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.86 
 
 		 721 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 742 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.76 
 
 		 712 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.04 
 
 		 706 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 728 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 672 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.71 
 
 		 706 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 705 aa  97.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.04 
 
 		 706 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.04 
 
 		 706 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 675 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  21.88 
 
 		 725 aa  95.1  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 740 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 723 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 717 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 723 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 700 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 700 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 715 aa  92  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 720 aa  90.5  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 700 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 781 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.01 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  23.41 
 
 		 692 aa  89.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.01 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 692 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 700 aa  88.6  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 680 aa  87.8  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.75 
 
 		 726 aa  87.4  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 700 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 700 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  23.14 
 
 		 765 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  22.28 
 
 		 713 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 706 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.46 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 678 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 712 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 712 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 701 aa  81.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 731 aa  80.9  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 705 aa  80.5  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 689 aa  80.5  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 703 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.2 
 
 		 691 aa  77.4  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  22.26 
 
 		 730 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 770 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 710 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.24 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 713 aa  74.3  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  23.58 
 
 		 791 aa  73.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 717 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 708 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 791 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 735 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  21.43 
 
 		 730 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.55 
 
 		 724 aa  72  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 779 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 705 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>