90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4063 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  75.7 
 
 		 689 aa  1047    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 712 aa  1414    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  59.94 
 
 		 723 aa  752    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  60.19 
 
 		 718 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  59.87 
 
 		 740 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  82.08 
 
 		 672 aa  1108    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  53.02 
 
 		 765 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  50.77 
 
 		 689 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  47.16 
 
 		 722 aa  631  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  49.46 
 
 		 705 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  51.16 
 
 		 699 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  46.02 
 
 		 676 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  43.29 
 
 		 717 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  44.41 
 
 		 678 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  44.53 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  42.52 
 
 		 765 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  43.89 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  42.24 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 678 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 760 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 736 aa  333  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 		 734 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  33.07 
 
 		 748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 750 aa  298  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 757 aa  293  7e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 733 aa  164  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 704 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 704 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.98 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.71 
 
 		 716 aa  54.3  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 683 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 720 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.46 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 702 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  49.7  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 700 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  27.59 
 
 		 700 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  27.59 
 
 		 700 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  21.28 
 
 		 683 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 850 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 828 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 689 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 778 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 778 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 686 aa  47.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 680 aa  47.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 649 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.42 
 
 		 614 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.42 
 
 		 614 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 662 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.42 
 
 		 614 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.91 
 
 		 713 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.42 
 
 		 614 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  20.72 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 688 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 743 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.38 
 
 		 614 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 728 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 828 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 678 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.37 
 
 		 616 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 743 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 732 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 695 aa  45.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 744 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  23.53 
 
 		 680 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 702 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 702 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 828 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  41.1 
 
 		 671 aa  45.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 696 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  33.7 
 
 		 628 aa  45.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 617 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.04 
 
 		 623 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 713 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 712 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 759 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 743 aa  44.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 667 aa  44.3  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 738 aa  44.3  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>