More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0423 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 696 aa  1399    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  38.81 
 
 		 762 aa  458  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 770 aa  296  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 703 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 780 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 688 aa  230  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 690 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 680 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 682 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 688 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.72 
 
 		 706 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.72 
 
 		 706 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.72 
 
 		 721 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.72 
 
 		 706 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.72 
 
 		 706 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 728 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 700 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 700 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 700 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.17 
 
 		 700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.17 
 
 		 700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 700 aa  164  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 700 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 675 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 715 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 709 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 705 aa  147  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 680 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 692 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.59 
 
 		 726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  21.4 
 
 		 691 aa  128  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 698 aa  120  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 701 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.63 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 731 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 757 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 742 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 694 aa  112  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 701 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 723 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 		 706 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 720 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  20.76 
 
 		 705 aa  101  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  20.89 
 
 		 792 aa  101  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 700 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  21.89 
 
 		 710 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 715 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 706 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  21.04 
 
 		 717 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 726 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 723 aa  94  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 723 aa  93.6  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 713 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  20.3 
 
 		 743 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  22.42 
 
 		 690 aa  91.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 681 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 698 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23.44 
 
 		 797 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 690 aa  88.6  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.91 
 
 		 712 aa  88.2  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 736 aa  88.2  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 702 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  20.97 
 
 		 706 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  21.52 
 
 		 701 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 716 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 742 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  22.02 
 
 		 727 aa  84  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 711 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  21.44 
 
 		 737 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.44 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 702 aa  82.4  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  21.96 
 
 		 706 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  20.32 
 
 		 785 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 730 aa  80.5  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  21.82 
 
 		 716 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 689 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 720 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 698 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  21.82 
 
 		 706 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  20.93 
 
 		 718 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  19.95 
 
 		 746 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 732 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  20.4 
 
 		 710 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 705 aa  78.2  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 689 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 697 aa  77.8  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  20.67 
 
 		 710 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  20.95 
 
 		 770 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  19.63 
 
 		 702 aa  77.4  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 828 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 786 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>