More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1994 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1438    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 700 aa  534  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 701 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 675 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 688 aa  157  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 700 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 700 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 700 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 709 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 700 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 700 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 711 aa  138  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.5 
 
 		 700 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.5 
 
 		 700 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.31 
 
 		 706 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.19 
 
 		 706 aa  137  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.2 
 
 		 706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 705 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 696 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 702 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 705 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 681 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 720 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 728 aa  111  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 757 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  21.81 
 
 		 691 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 694 aa  105  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 705 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  20.14 
 
 		 706 aa  100  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 701 aa  99.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 723 aa  99  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 720 aa  98.6  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.63 
 
 		 762 aa  99  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 731 aa  98.2  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  23.13 
 
 		 670 aa  97.8  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 791 aa  97.4  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 776 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.67 
 
 		 712 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 779 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 776 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.99 
 
 		 774 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 688 aa  95.1  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 681 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.41 
 
 		 743 aa  94.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 697 aa  94.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 774 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.99 
 
 		 774 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.99 
 
 		 774 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 709 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 774 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 713 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  29.79 
 
 		 706 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 770 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 692 aa  90.5  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 757 aa  90.5  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 774 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  29.48 
 
 		 721 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.24 
 
 		 726 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 715 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 778 aa  89  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 634 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 682 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 677 aa  87.8  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 702 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 717 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.31 
 
 		 653 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 714 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  25.25 
 
 		 730 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  25.24 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  21.26 
 
 		 774 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 777 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  20.22 
 
 		 678 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  22.15 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 833 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  21.25 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 703 aa  82.4  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 782 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  20.13 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 687 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  23.48 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.05 
 
 		 782 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 698 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 779 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  21.15 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 735 aa  79  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 746 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  21.28 
 
 		 659 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 680 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  21.54 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>