More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1763 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 703 aa  1414    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  42.39 
 
 		 690 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  38.07 
 
 		 688 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  39.38 
 
 		 682 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  39.48 
 
 		 680 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 770 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 780 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 696 aa  263  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  26.6 
 
 		 762 aa  190  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 675 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 728 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 715 aa  160  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 705 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.1 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 688 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 691 aa  150  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 700 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.05 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.91 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.39 
 
 		 721 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.78 
 
 		 706 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.26 
 
 		 700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.26 
 
 		 700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.25 
 
 		 706 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 700 aa  146  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 680 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 681 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 700 aa  142  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 705 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 706 aa  140  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 694 aa  137  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 678 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 701 aa  132  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 709 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 706 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25 
 
 		 710 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  27.88 
 
 		 712 aa  123  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.73 
 
 		 743 aa  123  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 723 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 731 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 742 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  24.54 
 
 		 797 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 723 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 711 aa  104  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 726 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 692 aa  97.8  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 742 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 736 aa  94  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 705 aa  93.2  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.52 
 
 		 701 aa  91.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 757 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.88 
 
 		 712 aa  87.8  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 774 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 776 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 697 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 776 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 736 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 690 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  24 
 
 		 690 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 791 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 702 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 785 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 712 aa  70.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 851 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 853 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 787 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.78 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 681 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 733 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 786 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  21.91 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 769 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 697 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 836 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>