More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2704 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  58.09 
 
 		 713 aa  810    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  57.87 
 
 		 717 aa  813    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  58.15 
 
 		 715 aa  814    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  68.51 
 
 		 698 aa  965    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  57.35 
 
 		 706 aa  790    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 700 aa  1423    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  56.72 
 
 		 702 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  69.33 
 
 		 733 aa  959    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  56.39 
 
 		 716 aa  795    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 714 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  41.97 
 
 		 727 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  41.16 
 
 		 737 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 736 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 742 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  40.74 
 
 		 681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  38.97 
 
 		 734 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  39.55 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 692 aa  442  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  40.34 
 
 		 664 aa  442  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  37.22 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  35.72 
 
 		 678 aa  353  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  34.76 
 
 		 712 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 688 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 690 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  30.42 
 
 		 690 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  29.84 
 
 		 715 aa  224  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 708 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 787 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 702 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 739 aa  218  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 800 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 785 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 740 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 712 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 786 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 731 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 680 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 688 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 678 aa  128  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 697 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.53 
 
 		 691 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 700 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 705 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 723 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.41 
 
 		 706 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.41 
 
 		 706 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.71 
 
 		 721 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.5 
 
 		 700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.5 
 
 		 700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 700 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.41 
 
 		 706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.57 
 
 		 706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 720 aa  111  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 706 aa  110  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 		 701 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 720 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 705 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 715 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 696 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.22 
 
 		 712 aa  97.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 780 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 742 aa  96.3  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 770 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.65 
 
 		 726 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23.75 
 
 		 762 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 680 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 701 aa  90.5  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 682 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 681 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 702 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 710 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 694 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.68 
 
 		 712 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 684 aa  82.4  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 698 aa  81.3  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 769 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 736 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 776 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 		 788 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 777 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  30.54 
 
 		 797 aa  77.4  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 774 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 687 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>