More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2555 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  58.23 
 
 		 690 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  57.16 
 
 		 718 aa  798    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  55.36 
 
 		 688 aa  756    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  55.3 
 
 		 708 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  57.02 
 
 		 690 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 702 aa  1424    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  39.35 
 
 		 715 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  31.79 
 
 		 727 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 726 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  32.46 
 
 		 712 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 737 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 736 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 742 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 681 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 678 aa  221  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 700 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 692 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 714 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 717 aa  210  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 681 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 713 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 702 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 800 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 706 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 716 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 733 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 664 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 740 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 712 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 776 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 776 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 688 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 769 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 675 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 774 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 787 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 770 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 785 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 678 aa  99.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 739 aa  95.5  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 720 aa  95.1  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.27 
 
 		 726 aa  88.2  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  20.25 
 
 		 701 aa  87.8  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 708 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 693 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 728 aa  85.9  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 694 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.16 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  27.25 
 
 		 797 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 791 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.92 
 
 		 706 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.74 
 
 		 706 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.92 
 
 		 721 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.78 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 711 aa  78.2  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 680 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 715 aa  77.8  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  19.63 
 
 		 696 aa  77.4  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  32.42 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 653 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  29.86 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  22.1 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 731 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 688 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  21.57 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  21.57 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  26.57 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  20.5 
 
 		 781 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 727 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>