More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2153 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  59.54 
 
 		 807 aa  985    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  67.8 
 
 		 836 aa  1169    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  68.9 
 
 		 815 aa  1093    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 828 aa  1688    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  59.6 
 
 		 845 aa  1027    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  65.31 
 
 		 828 aa  1117    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 747 aa  210  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 861 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 709 aa  127  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 742 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 764 aa  119  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.34 
 
 		 653 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 686 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.3 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  22.79 
 
 		 833 aa  108  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.86 
 
 		 650 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.86 
 
 		 650 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.86 
 
 		 650 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1147 aa  106  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.86 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.8 
 
 		 659 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 715 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.57 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 776 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 657 aa  104  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.63 
 
 		 726 aa  104  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 795 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.71 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.71 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.71 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.71 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.71 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  20.75 
 
 		 714 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.71 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  21.57 
 
 		 638 aa  101  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  21.78 
 
 		 634 aa  100  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 		 789 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 710 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.53 
 
 		 706 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  21.11 
 
 		 648 aa  98.6  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 700 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 700 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 700 aa  98.2  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 700 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.78 
 
 		 700 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.78 
 
 		 700 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 778 aa  97.8  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 675 aa  97.4  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.44 
 
 		 706 aa  97.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 700 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.44 
 
 		 721 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.44 
 
 		 706 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.08 
 
 		 693 aa  97.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.44 
 
 		 706 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 688 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 700 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 735 aa  94.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 679 aa  94  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 702 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 769 aa  94  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1004 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 700 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 705 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 935 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 742 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  22.52 
 
 		 668 aa  92  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 780 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.66 
 
 		 704 aa  91.3  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 699 aa  90.9  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  23.36 
 
 		 693 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  22.19 
 
 		 673 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 668 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 690 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 675 aa  89.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 748 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 754 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 744 aa  90.1  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 705 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 759 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.26 
 
 		 714 aa  89.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 833 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 783 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 971 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 671 aa  89  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.61 
 
 		 646 aa  88.2  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1062 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 761 aa  88.6  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 613 aa  88.2  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 918 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 698 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 801 aa  87.4  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1062 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1085 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1066 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 991 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 893 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 798 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 757 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>