More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1161 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  43.99 
 
 		 966 aa  688    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1899    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1089 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 897 aa  282  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1087 aa  277  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  48.83 
 
 		 888 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  45.65 
 
 		 952 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 753 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1126 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1122 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1120 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1109 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1147 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 957 aa  95.1  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 777 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 828 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 747 aa  92  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 920 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 771 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  47.66 
 
 		 1066 aa  88.6  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  30.36 
 
 		 791 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 933 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 797 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1054 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  31.74 
 
 		 822 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 792 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 924 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1004 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  44.76 
 
 		 1075 aa  78.2  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  27.39 
 
 		 780 aa  77.8  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 962 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 767 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 1001 aa  75.5  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 814 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 991 aa  74.3  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 760 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 793 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1123 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  30.09 
 
 		 848 aa  72.8  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 781 aa  72  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 874 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.24 
 
 		 750 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1066 aa  71.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.63 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  26.84 
 
 		 827 aa  70.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 932 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 806 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  31.6 
 
 		 1041 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 814 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 772 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 779 aa  68.2  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 824 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 957 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 778 aa  67.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.61 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1149 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 918 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 798 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  39.52 
 
 		 893 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 931 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1182 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 927 aa  65.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  28.11 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 775 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1188 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 821 aa  65.1  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 852 aa  65.1  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  47.76 
 
 		 1192 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1007 aa  64.3  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  29.37 
 
 		 729 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 727 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.14 
 
 		 1050 aa  64.3  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.27 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.6 
 
 		 972 aa  63.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.95 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>