232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1307 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 779 aa  1590    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  41.56 
 
 		 777 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  40.46 
 
 		 797 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 771 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  37.07 
 
 		 791 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 800 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  35.91 
 
 		 822 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  33.17 
 
 		 767 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 772 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 875 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 874 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 806 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.78 
 
 		 800 aa  98.2  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 790 aa  97.8  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  26.71 
 
 		 872 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.16 
 
 		 789 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 881 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 772 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.88 
 
 		 719 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 		 775 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 791 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  22.3 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 923 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 804 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 793 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  24.92 
 
 		 780 aa  79.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  21.84 
 
 		 775 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 791 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 814 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 927 aa  74.3  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 924 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23.8 
 
 		 888 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  35.34 
 
 		 805 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  21.53 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 933 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 962 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 935 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  19.86 
 
 		 906 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 931 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 800 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1089 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 814 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  26.06 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 957 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1036 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 865 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  24.35 
 
 		 860 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  24.35 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 1001 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 831 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 966 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1014 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 781 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 759 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  27.67 
 
 		 799 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 1011 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  26.45 
 
 		 827 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1003 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 800 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  34.29 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  21.95 
 
 		 802 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 730 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  24.01 
 
 		 821 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1126 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  22.83 
 
 		 928 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1059 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 828 aa  57.4  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1120 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1122 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 727 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 743 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 957 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 938 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 1087 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1057 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 986 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1075 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 920 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 888 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.1 
 
 		 917 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1109 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1052 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 902 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 735 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 781 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 962 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 973 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>