More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4595 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  56.23 
 
 		 729 aa  752    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  55.49 
 
 		 743 aa  755    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  55.19 
 
 		 727 aa  750    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  94.11 
 
 		 781 aa  1474    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  53.69 
 
 		 730 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 781 aa  1586    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  48.05 
 
 		 757 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  46.85 
 
 		 707 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  46.44 
 
 		 708 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  44.96 
 
 		 766 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  44.94 
 
 		 730 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 749 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 871 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 993 aa  96.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.79 
 
 		 859 aa  84.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 828 aa  84  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 897 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 777 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 888 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 966 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 815 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  27.82 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.43 
 
 		 791 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.45 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 779 aa  67.8  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 872 aa  67.8  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.42 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.44 
 
 		 666 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.9 
 
 		 994 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 705 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 1149 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  27.96 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.87 
 
 		 917 aa  65.1  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  27.96 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  27.96 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  35.54 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  21.36 
 
 		 680 aa  63.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1122 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.81 
 
 		 997 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1126 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 935 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.59 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  21.16 
 
 		 881 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  22.24 
 
 		 791 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 814 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.77 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  26.53 
 
 		 1001 aa  60.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1105 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  25.78 
 
 		 966 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 924 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1109 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 772 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23.19 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.13 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.13 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.13 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.13 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.02 
 
 		 1195 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.13 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 671 aa  57.4  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 772 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  22.29 
 
 		 641 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.13 
 
 		 663 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 972 aa  57.4  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.13 
 
 		 659 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 952 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 751 aa  56.6  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  23.91 
 
 		 626 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32 
 
 		 656 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  21.75 
 
 		 803 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  22.16 
 
 		 813 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 809 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  29.25 
 
 		 650 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  28.48 
 
 		 650 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  30.63 
 
 		 572 aa  55.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  29.25 
 
 		 650 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1075 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  29.25 
 
 		 650 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.25 
 
 		 650 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.21 
 
 		 822 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 806 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  26.27 
 
 		 1025 aa  54.7  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 791 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  21.89 
 
 		 739 aa  54.7  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  20.44 
 
 		 800 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>