165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0895 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 806 aa  1653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 827 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 820 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 847 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 817 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 725 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 816 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 805 aa  296  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 611 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 814 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 799 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 818 aa  260  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 813 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 883 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 813 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 805 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 808 aa  224  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 705 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  26.42 
 
 		 709 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 897 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 795 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 820 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 821 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 822 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 794 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.21 
 
 		 815 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 830 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 793 aa  180  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 869 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 805 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 818 aa  171  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 824 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 810 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 812 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 766 aa  164  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 832 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 802 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 748 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 804 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 826 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 829 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 853 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 791 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 934 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 973 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 705 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 852 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 803 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 817 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 828 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.18 
 
 		 894 aa  117  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 814 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 819 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 800 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  29.69 
 
 		 961 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 866 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.4 
 
 		 946 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 998 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  30.4 
 
 		 772 aa  91.3  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 823 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 812 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  30.84 
 
 		 887 aa  87.8  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 813 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  30.21 
 
 		 926 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.75 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  21.27 
 
 		 782 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  27.94 
 
 		 930 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  29.24 
 
 		 924 aa  74.3  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.07 
 
 		 921 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.08 
 
 		 891 aa  71.6  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.54 
 
 		 952 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.19 
 
 		 965 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.4 
 
 		 915 aa  68.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.05 
 
 		 920 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  29.24 
 
 		 904 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  23.58 
 
 		 995 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  25.59 
 
 		 895 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1105 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  29.93 
 
 		 847 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  24.89 
 
 		 872 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  22.9 
 
 		 936 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  30.38 
 
 		 908 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  23.61 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  22.84 
 
 		 931 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  26.42 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 817 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  27.98 
 
 		 767 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  30.65 
 
 		 838 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1075 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1004 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 897 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 748 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1107 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 781 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1066 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.26 
 
 		 944 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 760 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1148 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>