156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2981 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 816 aa  1677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  42.06 
 
 		 827 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 817 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 820 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 814 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 847 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 813 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 805 aa  356  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 806 aa  307  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 725 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 820 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 813 aa  287  5.999999999999999e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 897 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 705 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  29.57 
 
 		 709 aa  264  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 883 aa  263  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 799 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 810 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 795 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 821 aa  230  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 808 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 794 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 793 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 802 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 818 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 830 aa  218  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.63 
 
 		 805 aa  214  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 817 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 813 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 822 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 824 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 803 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 800 aa  198  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 812 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 973 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 791 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 829 aa  180  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 934 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 828 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.36 
 
 		 815 aa  175  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 866 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 832 aa  170  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 812 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 852 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 810 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 748 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 814 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  26.79 
 
 		 772 aa  127  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 766 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 823 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 804 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 853 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 826 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.74 
 
 		 894 aa  104  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  31.99 
 
 		 961 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 705 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 869 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  19.59 
 
 		 782 aa  91.3  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 819 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.61 
 
 		 715 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 998 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.35 
 
 		 946 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.25 
 
 		 952 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.27 
 
 		 921 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.36 
 
 		 926 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.62 
 
 		 929 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  22.55 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  26.83 
 
 		 895 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  24 
 
 		 887 aa  64.3  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.78 
 
 		 915 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  23.57 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.46 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  22.74 
 
 		 995 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 933 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.57 
 
 		 904 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1074 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 946 aa  55.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 760 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25.33 
 
 		 879 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  22.57 
 
 		 792 aa  54.3  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 919 aa  54.3  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  27.46 
 
 		 808 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  29.38 
 
 		 788 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 988 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 874 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 807 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 816 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 920 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.64 
 
 		 833 aa  51.2  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 972 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1090 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 938 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1089 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  33.88 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 833 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1102 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 769 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>