More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3536 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 812 aa  1639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 973 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  38.32 
 
 		 852 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 853 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 934 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  36.64 
 
 		 802 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 813 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 869 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 817 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 832 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 812 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 822 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 821 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 810 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  29.55 
 
 		 815 aa  286  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 766 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 826 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 808 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.97 
 
 		 894 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 818 aa  266  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 830 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 820 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 819 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 791 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.58 
 
 		 715 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 824 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 866 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 810 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 827 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 805 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 804 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 817 aa  217  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 805 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 803 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 818 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 847 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 816 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 705 aa  190  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 814 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 813 aa  184  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 883 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 611 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 725 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 799 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 806 aa  161  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 795 aa  157  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 820 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 793 aa  154  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 805 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 794 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 800 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 823 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.65 
 
 		 709 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 813 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 998 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 814 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 748 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.46 
 
 		 946 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 897 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  29.39 
 
 		 965 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  26.99 
 
 		 961 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.39 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.76 
 
 		 924 aa  74.3  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 705 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  27.03 
 
 		 952 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.62 
 
 		 926 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.86 
 
 		 944 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  24.73 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  20.95 
 
 		 782 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  25.7 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 849 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  25 
 
 		 920 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 931 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 957 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 678 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.75 
 
 		 930 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 962 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  31.43 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 961 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.29 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  22.69 
 
 		 887 aa  58.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.6 
 
 		 929 aa  57.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 734 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 1004 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  23.67 
 
 		 651 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 972 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 962 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  26.49 
 
 		 895 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.01 
 
 		 915 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 904 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 767 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 904 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 695 aa  56.2  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>