99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1715 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  100 
 
 		 887 aa  1811    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.36 
 
 		 961 aa  353  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 998 aa  327  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  29.63 
 
 		 946 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.69 
 
 		 965 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  28.65 
 
 		 920 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.97 
 
 		 921 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  28.49 
 
 		 930 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.47 
 
 		 952 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.74 
 
 		 924 aa  257  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  28.18 
 
 		 929 aa  256  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.08 
 
 		 929 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  26.82 
 
 		 847 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.11 
 
 		 872 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.55 
 
 		 926 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.75 
 
 		 904 aa  177  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  34.39 
 
 		 908 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  37.17 
 
 		 944 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  31.45 
 
 		 895 aa  141  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.81 
 
 		 915 aa  135  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  30.81 
 
 		 936 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  25.03 
 
 		 946 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  29.6 
 
 		 891 aa  108  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 822 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  24.2 
 
 		 995 aa  97.8  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 810 aa  94.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 869 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 806 aa  87.8  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 826 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 852 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 820 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 813 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 813 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 847 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  28.92 
 
 		 879 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 832 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 803 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 804 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 814 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  20.5 
 
 		 817 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 820 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 802 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 823 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 821 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 973 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 766 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  21.53 
 
 		 805 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  25.31 
 
 		 877 aa  70.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 817 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 830 aa  67.8  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  28.48 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 799 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 814 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 818 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 818 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 816 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 805 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 824 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 813 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 866 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 725 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 		 897 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  20.38 
 
 		 815 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 827 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.16 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 		 812 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 883 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 812 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 819 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.63 
 
 		 782 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 705 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 763 aa  51.6  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 810 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 798 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 943 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 793 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1075 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  29.5 
 
 		 709 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 814 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 795 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 793 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.38 
 
 		 833 aa  47.8  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 961 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 932 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 941 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 942 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1004 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  30.14 
 
 		 808 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 817 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 		 719 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 972 aa  44.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>