148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0346 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 805 aa  1655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 820 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  37.47 
 
 		 827 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 817 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 816 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 897 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 813 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 847 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 818 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 814 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 810 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 805 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 813 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 820 aa  300  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 725 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 806 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 808 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 705 aa  277  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 799 aa  277  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 805 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 794 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 830 aa  270  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 821 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  28.21 
 
 		 709 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 795 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 793 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 818 aa  244  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 817 aa  227  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 824 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 883 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 802 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 803 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 812 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 869 aa  217  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 829 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 800 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 866 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 813 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 822 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 826 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 766 aa  204  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 810 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 791 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 973 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.18 
 
 		 815 aa  194  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 812 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 828 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 852 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 853 aa  180  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 832 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 748 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.34 
 
 		 715 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 804 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 814 aa  161  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  27.13 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.83 
 
 		 782 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 823 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 705 aa  127  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 894 aa  122  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 819 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.07 
 
 		 961 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 998 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  28.74 
 
 		 926 aa  95.1  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.55 
 
 		 924 aa  95.1  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  28.31 
 
 		 965 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  27.59 
 
 		 930 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  21.5 
 
 		 887 aa  80.1  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  24.79 
 
 		 952 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  24.71 
 
 		 921 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.6 
 
 		 946 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.06 
 
 		 908 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  25.42 
 
 		 920 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  25.81 
 
 		 891 aa  72.8  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.47 
 
 		 929 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  23.53 
 
 		 895 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.46 
 
 		 904 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  26.13 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  24.26 
 
 		 915 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.97 
 
 		 929 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 988 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.67 
 
 		 944 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  33.99 
 
 		 847 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 760 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 861 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 798 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 776 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 920 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1021 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 933 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 792 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 873 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.98 
 
 		 992 aa  55.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 787 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  28.95 
 
 		 960 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 769 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 753 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  25.25 
 
 		 808 aa  54.3  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>